7月19日，调查组由中科院秘书长汪克强带领，机关相关厅局负责同志一起赶赴合肥，对合肥物质科学研究院所属某研究单元开展实地调研。刘鹤副总理听取汇报后，立刻要求国务院办公厅、科技部和中科院三家单位组建专项工作组，奔赴合肥把事情原委搞清楚。随着90人集体离职的消息传开，外界猜测待遇落差、科研环境和团队氛围等问题，这些因素都可能影响到国家科研队伍的稳定与未来。国务院领导对这件事非常重视，做出了重要批示，要求把问题症结找准确。这次调查组阵容强大，他们直奔研究所档案室、财务处、人事系统及实验室展开地毯式核查。调查组成员现场取证、约谈当事人，力求还原事件全貌。媒体提问待遇差距问题时，调查组相关负责人表示调查还在进行中，所有信息以最终书面报告为准。这次专项组不仅是要查清事实，还要查找症结并提出对策。如果最终确认是体制机制漏洞，改革方案可能向全院推广；如果是个别研究所管理失当，问责也会追到底。汪克强带领着调查组于7月19日清晨抵达合肥进行实地调研。