在08年6月的一次体检中，林依晨大脑里发现了一个大约2厘米的囊肿，这个发现像是在她头顶上投下了一片乌云，把她所有的光明都给遮住了。医生告诉她，如果这个囊肿继续变大，可能会压迫她的视神经，甚至导致行动不便。那一瞬间，她第一次切身感受到了“生命倒计时”的滋味。当年，林依晨还在拍摄电视剧《天外飞仙》。到了09年2月初的时候，她就被推进了手术室。医生给她选择了一种微创手术方式，把内镜从鼻腔里伸进去，直接进入大脑内的脑垂体窝里面。这种方式虽然减少了身体上的创伤，但是风险却不小。在手术完成后醒来的时候，林依晨嘴里满是血腥味。那一刻她才真正感受到了死亡离她有多近。生理盐水不断从鼻腔里涌出来，她闭着眼睛听着仪器发出的嘀嗒声心里却空荡荡的：未来的路还能不能走下去？ 为了不让身体再出状况，林依晨把拍戏的工作量给砍到了原来的三分之一，拍戏空隙还得躺下来吸氧。以前常常熬夜的习惯也被她彻底戒掉了。回顾过去的时候，林依晨承认自己一直有一种压力感伴随着她十年的时间。刚开始的时候她拼命想证明自己是个演员：台词背到凌晨三点、吊威亚从不带替身、冬天跳水戏只穿一件单衣。这种压力就像是一个越滚越大的雪球一样在2008年崩溃掉了。林依晨说：“我以为自己能扛住这些压力，但身体比我想象中要脆弱得多。” 到了2011年9月的时候，林依晨突然宣布因为身体无法承受高强度的拍摄环境而暂时离开电视圈。她没有在媒体面前大哭大闹，只是说了一句“谢谢十年时间，现在该给心脏放个假了”。粉丝们在网上纷纷留言表示：“袁湘琴结婚了但林依晨却先把自己嫁给了健康。” 如今回想起那颗2厘米大小的囊肿，林依晨已经很淡定地把它比作一枚暗器：“它逼迫我暂停了生活、做了体检、学会了倾听身体的声音。”她现在开始做公益活动、拍摄短片、写播客：告诉年轻人不要把熬夜当作生活常态；用自己的经历告诉大家要懂得休息和与身体和解。