全国统一大市场建设取得阶段性进展的同时，市场主体仍面临不少现实难题；中国发展研究基金会理事长张军扩委员近期调研指出，尽管规则壁垒破除有所突破，招投标透明度也明显提高，但影响经济循环的深层矛盾仍未彻底化解。当前主要问题集中在三上：一是行政性垄断以更隐蔽的方式存在，部分地区通过技术标准、资质审查等设置“玻璃门”；二是要素市场化改革相对滞后于商品市场发展，数据、土地等关键要素跨区域流动仍有障碍；三是区域制度规则碎片化较为突出，与新经济形态的适配性不足。这些问题推高了社会交易成本。对应的研究测算，市场分割带来的效率损失约占GDP的3%—5%。
全国统一大市场建设既是破题之举，也是系统工程；只有统一规则、严格执法、协同治理中不断厘清政府与市场边界，持续推动政策落地，才能让要素资源在更大范围内高效流动，让公平竞争成为更清晰的市场底色，继续释放超大规模市场在稳增长、促创新、惠民生上的综合效应。