最近,中国科学院天津工业生物技术研究所的科研人员搞出了一项新招。之前大家习惯用杂交探针的办法来捕获DNA,不过这玩意在复杂的基因组环境里特别容易瞎结合,抓到些不该抓的东西,而且对那种特别少的DNA也不太好使。现在这个新技术就不一样了。研究团队把一种叫UdgX的酶和另一种蛋白SSBE3给融合到了一块,弄出了一个名叫UdgX-SSBE3的融合蛋白。在sgRNA的带路下,这玩意儿能精准地找到目标位点,先把胞嘧啶碱基改造成尿嘧啶,给目标DNA打上个分子标签;紧接着,UdgX会像探照灯一样认出这个标签,直接跟DNA分子粘上,形成牢不可破的共价结合。这种把碱基编辑和共价捕获合二为一的思路,把杂交捕获对探针设计的那些条条框框全给打破了,几乎什么样的位点都能抓。 为了看看这招行不行,研究人员拿一些跟疾病有关的突变片段和标准序列做了试验。结果显示,在一大堆杂乱的背景DNA里,这玩意儿抓得准极了,抓得到还抓得稳。而且它特别灵活,只要换个sgRNA,马上就能切换到别的目标上干活。这就好比有个智能机器人,你输入个命令它就能跟着去干活。 实验流程上这招也简单多了。他们用的是低密度sgRNA的策略,不仅省事儿不用额外标记操作,还能把杂交的时间给大大缩短。原本需要折腾24个小时的活儿现在几个小时就能搞定。因为省去了很多中间步骤,通量和效率都上去了。 即使是那些特别稀少的DNA样本,用UdgX-SSBE3技术照样能抓到又多又准的富集效果。跟以前主流的方法比起来,它不光覆盖范围广、重复性好、测序效果棒,在探针用量和成本控制上也更有优势。 别看这技术现在还在实验室里闹腾呢,以后在看病查病、肿瘤液体活检、抓病原体这些事儿上肯定能用得上。这玩意儿不仅给咱们的分子检测工具箱里加了把好刀,也为做基因组研究提供了新的路子。