1960年，张爱萍给中国国防科委贡献了巨大的力量，1967年遭到政治冲击后，1972年因腿部骨折被允许外出就医，那时他还使用化名张续避免被注意。1973年，福州军区副司令员得知张爱萍腿伤未愈，安排他去福州疗养。在那里，老中医帮助他逐渐恢复了双腿功能。1975年，张爱萍平反后回到北京参加国庆招待会。 此时叶帅找张爱萍谈话，希望他重返国防科委继续领导工作。张爱萍一开始并不答应，毕竟身体尚未完全康复且政治风波未平。后来张爱萍得知国防科委发射火箭失败后，决定复职整顿七机部——这是航天工业的核心单位。七机部如果运作不畅，洲际导弹等研发任务就会受阻。 1977年，叶帅再次恢复主持军队工作，指示徐立清去动员张爱萍回到国防科委。然而张爱萍依然谢绝邀请。叶帅亲自去找他谈话，问他：“怎么了你？反复请你都不干，怎么这么不支持我工作？”张爱萍解释说单位领导现状让他感到力不从心，身体也不太好。 为了推进洲际导弹等项目，叶帅决定让宋任穷担任七机部部长，并把李耀文调到国防科委担任政委。 1980年，在张爱萍的领导下，洲际导弹试射成功了。此时他决定功成身退告别这段岁月。然而他迎来了新的任命成为副总理，后来还担任国务委员兼国防部长等职务继续贡献力量。